1. 개요 및 목적
VRE (반코마이신 내성 장알균)은 항생제 반코마이신에 대한 내성이 생기면서 발생되는데 전염성이 높은 감염병중 하나이다.
VRE (반코마이신)에 내성을 보이는 대표적인 장알균으로는 E. faecium(VanA) 와 E. faecalis(VanB)가 있다. VanA와 VanB의 DNA를 가지고 GeneProof사의 VRE PCR Kit를 이용해 실험을 통하여 증폭 여부를 확인한다.
2. 실험 재료 및 기기
실험재료
- GeneProof VRE PCR Kit, VanA & VanB DNA, dH2O
실험기기
- Real Time PCR System (ex. QuantStudio5 - ABI, Thermo Fisher Scientific, USA)
3. 실험 방법 및 절차
① VanA & VanB DNA를 10배씩 희석한다.
| Sample 1 (100 copies/uL) | Sample 2 (10 copies/uL) | Sample 3 (1 copies/uL) |
DNA | Van A 2 uL | Sample 1 DNA 2 uL | Sample 2 DNA 2 uL |
Van B 2 uL |
dH2O | 16 uL | 18 uL | 18 uL |
Total | 20uL | 20 uL | 20 uL |
② PCR 샘플 시약 조성
| Sample 1~3 | N.C. |
Master Mix* | 30 uL | 30 uL |
Internal Standard** | 1 uL | 1 uL |
DNA | 9 uL | - |
dH2O | - | 9 uL |
Total | 40 uL | 40 uL |
* Master Mix에 Primer와 Probe가 포함되어 있다.
**키트 내에 있는 Internal Standard를 추출 시 샘플에 넣어 사용하지만, 추출하지 않는 경우에는 DNA 9 uL, Internal Standard 1 uL를 넣어 PCR을 진행한다.
4. 실험 결과와 결과의 해석
- Sample 1 (100 copies/uL)의 결과 그래프
- Sample 2 (10 copies/uL)의 결과 그래프
- Sample 3 (1 copies/uL)의 결과 그래프
- N.C. 결과 그래프
- Van A의 경우 FAM에서 증폭을 확인 했고, Van B는 Cy5에서 증폭이 되었음을 확인 했다.
- IS (Internal Standard)의 경우 HEX에서 증폭을 확인 했다.
5. 주의 사항
① Real time PCR 돌릴 때, multi PCR 이므로 각 타겟에 맞는 형광을 선택을 해야한다.
② DNA를 희석할 때, 정확한 양을 파이펫으로 옮겨서 희석을 하도록 주의한다.
③ 시약의 유효기간을 확인한 뒤 실험한다.
④ 실험 시 오염에 주의하며 진행한다.
* 본 실험에 사용 된 Kit는 GeneProof의 VRE PCR Kit를 사용했습니다.
김민지
경기도 수원시 영통구 대학4로 17 (이의동) 에이스광교타워1 3층 308호
Tel.(+82)031-899-8620 Fax.(+82)031-899-8621
E-mail. mjkim@biomedux.com
목차
1.개요 및 목적
2. 실험 재료 및 기기
3. 실험 방법 및 절차
4. 실험 결과
5. 주의 사항
1. 개요 및 목적
VRE (반코마이신 내성 장알균)은 항생제 반코마이신에 대한 내성이 생기면서 발생되는데 전염성이 높은 감염병중 하나이다.
VRE (반코마이신)에 내성을 보이는 대표적인 장알균으로는 E. faecium(VanA) 와 E. faecalis(VanB)가 있다. VanA와 VanB의 DNA를 가지고 GeneProof사의 VRE PCR Kit를 이용해 실험을 통하여 증폭 여부를 확인한다.
2. 실험 재료 및 기기
실험재료
- GeneProof VRE PCR Kit, VanA & VanB DNA, dH2O
실험기기
- Real Time PCR System (ex. QuantStudio5 - ABI, Thermo Fisher Scientific, USA)
3. 실험 방법 및 절차
① VanA & VanB DNA를 10배씩 희석한다.
2 uL
2 uL
② PCR 샘플 시약 조성
* Master Mix에 Primer와 Probe가 포함되어 있다.
**키트 내에 있는 Internal Standard를 추출 시 샘플에 넣어 사용하지만, 추출하지 않는 경우에는 DNA 9 uL, Internal Standard 1 uL를 넣어 PCR을 진행한다.
4. 실험 결과와 결과의 해석
- Sample 1 (100 copies/uL)의 결과 그래프
- Sample 2 (10 copies/uL)의 결과 그래프
- Sample 3 (1 copies/uL)의 결과 그래프
- N.C. 결과 그래프
5. 주의 사항
① Real time PCR 돌릴 때, multi PCR 이므로 각 타겟에 맞는 형광을 선택을 해야한다.
② DNA를 희석할 때, 정확한 양을 파이펫으로 옮겨서 희석을 하도록 주의한다.
③ 시약의 유효기간을 확인한 뒤 실험한다.
④ 실험 시 오염에 주의하며 진행한다.
* 본 실험에 사용 된 Kit는 GeneProof의 VRE PCR Kit를 사용했습니다.
김민지
경기도 수원시 영통구 대학4로 17 (이의동) 에이스광교타워1 3층 308호
Tel.(+82)031-899-8620 Fax.(+82)031-899-8621
E-mail. mjkim@biomedux.com