바이오메듀스에서 개발 시판되고 있는 Human Genome EXT & PCR Test의 분자생물학 입문자들을 위한 교육용 실험 키트로서의 효능성을 알아보기 위해 직접 실험해보았습니다.

1. 이 제품은 자신의 구강상피세포(또는 모근, 소변)에서 직접 DNA를 추출하여 미토콘드리아의 16S rRNA 유전자의 일부 구간을 PCR하고 전기영동으로 결과를 확인해보는 실험으로 실험 방법은 비교적 쉽고 간단하였고 먼저 결과 사진을 첨부합니다.

2. 사진이 좀 삐뚫어 졌지만 맨 좌측부터 1Kb ladder, 실험메뉴얼에 의한 추출 DNA, 실험메뉴얼에 의한 추출 DNA, 키트에 제공된 DNA, negative control, 면봉에 묻은 침으로 추출한 DNA, 면봉에 묻은 침으로 추출한 DNA,  키트에 제공된 DNA, negative control 이며 면봉에 묻은 침으로 추출한 DNA lane에서만 조금 흐리게 밴드가 나타났고 나머지는 모두 매우 선명하게 잘 나왔습니다.

3. 이 실험 키트는 구강가글액으로 DNA를 추출하는 것만 잘하면 앞의 실험키트(람다PCR)에서와 마찬가지로 PCR시료가 primade되어 주어진 용량의 DNA 또는 멸균증류수를 넣어 PCR을 하면 어김없이 결과가 잘 나올 수 있도록 실험 설계가 되어 있습니다.

4. DNA추출할 때 제가 한 방법을 상세히 포스팅하면 

1) 식수 10mL를 종이컵에 받아 1분간 구강내부를 이빨을 이용하여 살짝씩 긁어가며 가글링하고 이를 다시 종이컵에 밷고

2) 가글액 1mL를 마이크로튜브(1.5mL튜브)에 넣고 13500RPM으로 1분간 원심분리 후 마이크로피펫을 이용하여 pellet만 남기고 액체 모두를 제거

3) 시료전처리액 50uL넣고 in & out 피펫팅으로 균질화하고

4) 핫블럭에 95도 10분 반응하는 과정부터 이 후는 메뉴얼대로 수행

5. 면봉에 묻은 침을 이용하는 방법은 밴드가 흐리게 나왔으므로 자세한 과정은 생략하지만 실험자가 보다 간단하게 DNA를 추출할 수 있는 방법이 있다면 새로운 방법을 도전해보는 것도 좋겠습니다. 과학은 창의성이 중요하니까요.

* 면봉으로 해보실 분은 침을 묻히지 마시고 구강벽만을 잘 긁어 재도전 해보시면 더 나은 결과가 나올 수도 있다고 바이오메듀스 연구개발자의 조언이 있었습니다.

[실험 소감]

  앞의 실험키트(람다PCR)에서와 마찬가지로 PCR시료(dNTP, Taq polymerrase 등의 PCR mix와 templet DNA)를 하나하나 실험자가 마이크로피펫으로 정량하여 넣어야 하나 본 제품은 이 과정이 생략되고 PCR시료 전체가 동결건조분말로 제작되어 멸균증류수만 넣도록 설계되어 세밀한 실험 기법을 익히지는 못하지만 분자생물학 실험 기법이 초보인 학생들에게는 짧은 시간에 쉽게 이론으로만 학습한 DNA추출과 PCR, 전기영동을 실증적 실험 결과를 볼 수 있도록 하여 이 분야에 대한 호기심과 꿈을 품어보는데 좋은 경험을 줄 수 있겠다는 생각이 듭니다.